Η ΟΛΘ Α.Ε. εξυπηρετεί ένα πλήρες φάσμα ειδικού φορτίου τόσο στον Σταθμό Εμπορευματοκιβωτίων (Σ.ΕΜΠΟ) όσο και στον Σταθμό Συμβατικού Φορτίου, το οποίο περιλαμβάνεται στην διαχείριση του Γενικού φορτίου.
Ειδικά φορτία είναι τα φορτία των οποίων οι διαστάσεις υπερβαίνουν τις συνήθεις διαστάσεις των εμπορευματοκιβωτίων και θεωρούνται υπερμεγέθη (oversized). Επιπλέον, τα φορτία που απαιτούν ειδική πρόσδεση ή απασφάλιση επί του πλοίου και φορτία μεγάλου βάρους και αξίας τα οποία απαιτούν ειδική μελέτη, χειρισμό και εξοπλισμό.
Ενδεικτικά, ως ειδικά φορτία μπορούν να χαρακτηριστούν φορτία που περιλαμβάνουν κατασκευές ή εξοπλισμό που δεν μπορεί να χωριστεί σε μικρότερα κομμάτια όπως είναι οι τουρμπίνες, οι γεννήτριες, οι συμπιεστές, ο κατασκευαστικός εξοπλισμός, οι λέβητες, το τροχαίο υλικό και ο πλωτός εξοπλισμός.
Η διαχείριση του ειδικού φορτίου καθορίζεται από τους Γενικούς Όρους Συμβατικού Λιμένα και το Τιμολόγιο Παροχής Υπηρεσιών Συμβατικού Λιμένα.